一.预约与收费规则
1.仪器使用时间:每周四和周六。 10:00-16:30;(9:00-10:00为机器启动及光路校正时间,16:30后为仪器管路清洗消毒时间);
2.预约请直接联系崔娜进行人工确认。
3.使用仪器前请至少提前一周向仪器负责人预约,并告知仪器负责人具体实验内容,仪器负责人根据仪器使用情况安排上机时间,如取消预约须至少提前一天告知仪器负责人,否则一律按照2小时收费;
(仪器负责人:崔娜 联系电话:021-68582512 邮箱:cuina@sioc.ac.cn)
4.收费标准:
院内用户: 500元/小时;院外学术用户850元/小时;院外非学术用户1300元/小时。
二.样品制备要求
1.上样前请针对不同的细胞样本进行相应处理,减少细胞粘连,使细胞形成单细胞悬液;
1.1.贴壁细胞消化后可用含2%FBS的PBS或无酚红RPMI-1640培养基重悬,禁止使用高糖培养基,以减少自发荧光干扰;
1.2.组织消化后因有许多DNA从死细胞中泄露,导致细胞粘连,请在消化液中加入DNaseI 25ug/ml+5mM MgCl2,并在后续抗体染色中往staining buffer中添加DNaseI 25ug/ml+5mM MgCl2;
2.细胞活力会直接影响分选后的细胞活性,同时死细胞会有较强的自发荧光干扰分选,因此必需用PI或7AAD染料区分死细胞,染色五分钟,离心2次,洗去染料,才能做后期荧光分选;
3.为保证分选效率,建议上样细胞浓度不低于1×107/ml;
4.为保证细胞活性,请将样品置于冰上;
5.实验对照设计:
5.1.转染荧光蛋白的细胞样品,需提供为转染的细胞样品以供校正
5.2.多种荧光抗体标记的样品,需要提供(a) 为染色的细胞样品 (b)每一种荧光抗体单独染色的样品,以供仪器校正和荧光补偿。
6.预实验设计:
6.1.荧光蛋白标记的细胞系可直接上机分选,不需要预实验;
6.2.从组织中分离的细胞尤其是含量稀少的细胞,请先做小规模的预实验,以测定细胞含量以及优化分选策略;
7.所有样品在上机前必须转移至带滤网的FACS管内上样(FALCON,货号:352235);
三.样品收集
1.活细胞收集:收集样品可选用不同规格离心管(5ml、15ml、50ml)和细胞培养板,请在分选前往离心管中加入1-2ml含有20%FBS的培养基,培养板中加入覆盖底面积的量;
2.DNA分离:收集管中提前加入PCR mix或lysis buffer;
3.RNA分离:收集管中提前加入Trizol或RLT buffer;
四.荧光素选择
实验采用多种荧光染色标记时,请用以下工具仔细对比,防止荧光发射光谱重叠,导致实验失败。
荧光光谱查看器:
http://www.bdbiosciences.com/cn/s/spectrumviewer
https://www.thermofisher.com/cn/zh/home/life-science/cell-analysis/labeling-chemistry/fluorescence-spectraviewer.html
五:MoFlo荧光通道信息:
激光器 | 带通滤片 | 常见染料 |
355 | 448/59 | DAPI, Hoechst |
620/29 | PI |
692/75 | BUV661 |
405 | 448/59 | DAPI, CFP, Alexa 405, eFluor 450 |
546/20 | eFluor 506 |
488 | 513/26 | EGFP, FITC, YFP, Alexa 488, Calcein AM |
576/21 | PE/R-PE |
620/29 | PI, PE-CF594, EB |
664/22 | PerCP, PE-Cy5, PE-Cy5.5, 7-AAD |
710/45 | PerCP-Cy5.5, PerCP-eFluor 710 |
795/70 | PE-Cy7 |
561 | 579/16 | Cy3, DsRed, tdTomato, PE, Rhodamine Red |
614/20 | mCherry, PI |
692/75 | PE-Cy5, PE-Cy5.5, 7-AAD |
640 | 671/30 | APC, Cy5, Alexa 647 |
722/44 | Alexa 700 |
795/70 | APC-Cy7 |
样品种类 | 细胞浓度 | 荧光标记 | 目的细胞群体 |
示例-1 HEK293T | 1×107/ml | GFP,PI | GFP |
示例-2 小鼠大脑消化细胞 | 2×107/ml | GFP-Alex488 PI CD31-Alexa647 CD146-PE-Cy7 | CD31-ALexa647+CD146-PE-Cy7 双阳性 |
六.样品信息表(上表)
分选实验室,请按照一下表格提供样品信息,以供分选是快速设定正确的荧光通道。
七.细胞分选所需时间参考
Frequency of cells of | 10% | 1.0% | 0.1% |
interest |
|
|
|
Starting number of | 1x107 | 1x108 | 1x109 |
cells required |
Time to sort 1x106 | 30 | 300 (5 hours) | 3000 (50 hours) |
cells (minutes) |
八.数据备份及分析
请自备空白光盘一张,用于拷贝实验数据,拷贝后请妥善保存实验数据。平台不承担任何因违反本
规定而导致的实验数据丢失、外泄等。严禁用U盘,擅自使用U盘者,将被禁用仪器3-6个月或取消仪器使用资格。
数据分析软件:Beckman Summit(可从Hu Lab拷贝)。